太空育種的部分目的是為了增產，所以確實會有很多太空蔬菜長得大，但也有一些甚至連果子都不結了。太空育種利用了基因的隨機突變，並不能保證長出來的果子都變大。
太空育種利用了生物演化的原理生物演化基於基因，而基因會突變，主要是基因鏈也會在生物化學或者物理因素作用下斷裂重構，或者發生鹼基的替換，結果使得基因的功能發生變化，反映在生物上就可能是外部性狀的變化。而體型增大隻是一個方面，正如地球生物起源於共同始祖，但是物種卻十分多樣一樣。生物演化基於基因的隨機突變，其演化結果也就是隨機的。
相較於地面環境，太空中由於缺乏大氣、磁場更弱、重力也更弱，因此來自太陽的輻射、帶電粒子更密集，攜帶著更高的能量，衝擊生物組織的時候就可能使生物的基因突變，獲得了新的基因材料。而這個過程毫無疑問也是隨機的，並不能保證種子到太空一圈下來就增產。變異只是第一步將經過太空環境的種子種下去，挑選出有利於人類的性狀，果子變大或者口味變得更好都在選擇範圍內，在以往的太空育種過程中，的確有不少植物的果實長得更大，但也有連種子也不結了，或者果實的口味發生了極大的變化，甜的變酸、酸的變淡，有的生長週期變長，有的生長週期變短，總的來說突變是很多方面的，並不集中在體型的變化；
並且由於種子新產生的變異相較於整個同類植物種群頻率很低，需要經過多代繁育，使人類需要的性狀被分離且穩定下來，有的還需要用到雜交等方面技術，具體看育種的目的。涉及的生物學原理到了這一步利用的生物學原理是孟德爾遺傳規律。生物自有的基因和部分變異基因會在生殖過程中遺傳給後代，在孟德爾時代孟德爾採取了巧妙的方法描述了生物的遺傳。他發現豌豆在某些方面的性狀有不同，性狀分離明顯，不同的基因型配對會導致自代性狀的不同。孟德爾採用歸納總結的方式獲得了豌豆的遺傳規律，在後續的實驗中可以完美地利用歸納獲得的遺傳規律預測子代的性狀比例，證實了遺傳規律的正確。
孟德爾還提出了一個重要的概念：遺傳因子。孟德爾的時代還不能深入觀測生物的染色體，但是他通過較大樣本的統計得出的遺傳規律卻放之四海而皆準，此後基於孟德爾的研究，科學家們又發現了伴性遺傳等遺傳規律，進一步地豐富了遺傳學。而他所提出的“遺傳因子”的概念現在被命名為基因。航天育種過程航天育種也是一樣，有了變異就要採取一定的措施將那些有利於人類的性狀固定下來，採用的方式就是自交、回交、雜交等方式，獲得性狀穩定的農作物品種，然後經過試驗栽培驗證安全性和穩定性，最後就是擴大種植留種，用於更廣泛的種植。
前文提到，太空育種的部分目的也是為了增產，那麼媒體自然會宣傳體型巨大的太空農作物，像太空南瓜單株植株上結的南瓜最多可以長到一兩百斤，這會給人留下深刻的印象，其它的培育出的口感更好營養更高的作物，由於太空農作物種植不廣泛，絕大多數人都沒嘗試過，自然不能留下深刻的印象。
